MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019971	AT	3	6	39	44	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019971	TA	3	6	152	157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019971	GGA	2	6	220	225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019971	AG	3	6	228	233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019971	CAAG	2	8	442	449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019971	CAA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019971	AG	3	6	694	699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019971	CAT	2	6	814	819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019971	ATC	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019971	ATC	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019971	ATC	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019971	A	7	7	956	962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019971	TAA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019971	AAT	2	6	1036	1041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019971	A	6	6	1060	1065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019971	T	6	6	1071	1076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019971	TTTA	2	8	1078	1085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019971	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019971	TGA	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
21	NC_019971	A	6	6	1164	1169	100 %	0 %	0 %	0 %	433659171
22	NC_019971	AAG	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
23	NC_019971	CTG	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
24	NC_019971	CAG	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
25	NC_019971	CAA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
26	NC_019971	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
27	NC_019971	TGC	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
28	NC_019971	TGC	2	6	1479	1484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
29	NC_019971	CAA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
30	NC_019971	TTG	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
31	NC_019971	CCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
32	NC_019971	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
33	NC_019971	CAC	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
34	NC_019971	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
35	NC_019971	TGA	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
36	NC_019971	GTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
37	NC_019971	ATC	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
38	NC_019971	CGC	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659171
39	NC_019971	A	6	6	1961	1966	100 %	0 %	0 %	0 %	433659171
40	NC_019971	ATCG	2	8	2003	2010	25 %	25 %	25 %	25 %	433659171
41	NC_019971	CCGCTT	2	12	2092	2103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433659171
42	NC_019971	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
43	NC_019971	CGT	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
44	NC_019971	GAA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
45	NC_019971	CTA	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
46	NC_019971	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659171
47	NC_019971	TCT	2	6	2238	2243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659171
48	NC_019971	CCA	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
49	NC_019971	AC	3	6	2323	2328	50 %	0 %	0 %	50 %	433659171
50	NC_019971	TGC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
51	NC_019971	CAAC	2	8	2580	2587	50 %	0 %	0 %	50 %	433659171
52	NC_019971	CAG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
53	NC_019971	CAT	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
54	NC_019971	AAAG	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	433659171
55	NC_019971	TCAA	2	8	2876	2883	50 %	25 %	0 %	25 %	433659171
56	NC_019971	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
57	NC_019971	TGAT	2	8	3161	3168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019971	GAT	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019971	TGA	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019971	CATT	2	8	3318	3325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019971	T	8	8	3364	3371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019971	TTC	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019971	TTG	3	9	3500	3508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
64	NC_019971	TGC	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659172
65	NC_019971	CATC	2	8	3711	3718	25 %	25 %	0 %	50 %	433659172
66	NC_019971	CAG	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659172
67	NC_019971	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
68	NC_019971	AGG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659172
69	NC_019971	CAT	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659172
70	NC_019971	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659173
71	NC_019971	CTG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
72	NC_019971	AGT	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
73	NC_019971	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659173
74	NC_019971	TTC	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
75	NC_019971	ATT	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659173
76	NC_019971	CGCTGA	2	12	4322	4333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433659173
77	NC_019971	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659173
78	NC_019971	TCT	2	6	4370	4375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
79	NC_019971	CCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659173
80	NC_019971	TGC	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
81	NC_019971	GAT	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
82	NC_019971	TG	3	6	4480	4485	0 %	50 %	50 %	0 %	433659173
83	NC_019971	TCGTG	2	10	4553	4562	0 %	40 %	40 %	20 %	433659173
84	NC_019971	TCT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
85	NC_019971	TTG	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019971	GCT	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019971	ATG	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019971	TCA	2	6	4979	4984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019971	TGA	2	6	5000	5005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019971	TTC	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019971	TC	3	6	5029	5034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019971	TTG	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019971	TC	3	6	5057	5062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019971	CAC	3	9	5067	5075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_019971	ATG	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019971	TGA	3	9	5266	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019971	GC	3	6	5369	5374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019971	CCA	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019971	GGC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019971	ATT	2	6	5689	5694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019971	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019971	TGAA	2	8	5761	5768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019971	A	7	7	5803	5809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019971	TGA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019971	TGA	2	6	5917	5922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019971	GT	3	6	6006	6011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019971	GGA	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019971	GAA	4	12	6086	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
109	NC_019971	CAG	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659174
110	NC_019971	GAA	2	6	6191	6196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
111	NC_019971	TC	3	6	6225	6230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019971	CAT	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019971	TGCT	2	8	6362	6369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019971	AT	3	6	6408	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019971	TTG	2	6	6430	6435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019971	ATC	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019971	CCA	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
118	NC_019971	ACT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659175
119	NC_019971	TTG	2	6	6598	6603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
120	NC_019971	ACA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
121	NC_019971	TCC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659175
122	NC_019971	ACC	2	6	6859	6864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
123	NC_019971	TGA	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
124	NC_019971	AAGCT	2	10	6940	6949	40 %	20 %	20 %	20 %	433659175
125	NC_019971	ATG	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
126	NC_019971	TCG	2	6	7150	7155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
127	NC_019971	GCG	2	6	7165	7170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659175
128	NC_019971	TGC	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
129	NC_019971	AGG	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659175
130	NC_019971	CAA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
131	NC_019971	GAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
132	NC_019971	TGC	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
133	NC_019971	TGA	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
134	NC_019971	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
135	NC_019971	AAG	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659175
136	NC_019971	CAAC	2	8	7451	7458	50 %	0 %	0 %	50 %	433659175
137	NC_019971	CAAA	2	8	7477	7484	75 %	0 %	0 %	25 %	433659175
138	NC_019971	TTG	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
139	NC_019971	TC	3	6	7664	7669	0 %	50 %	0 %	50 %	433659176
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